个体工商户的营业执照在网上进行注销的流程有：前往工商管理部门网站；登录账号，选择注销；填写相关资料并提交材料；经审查通过之后即可以成功注销。网上注销不予通过的，当事人可以携带相关材料原件前往工商管理部门进行线下注销。
法律依据：
《中华人民共和国市场主体登记管理条例实施细则》第二十三条
市场主体营业执照应当载明名称、法定代表人（执行事务合伙人、个人独资企业投资人、经营者或者负责人）姓名、类型（组成形式）、注册资本（出资额）、住所（主要经营场所、经营场所）、经营范围、登记机关、成立日期、统一社会信用代码。
电子营业执照与纸质营业执照具有同等法律效力，市场主体可以凭电子营业执照开展经营活动。
市场主体在办理涉及营业执照记载事项变更登记或者申请注销登记时，需要在提交申请时一并缴回纸质营业执照正、副本。对于市场主体营业执照拒不缴回或者无法缴回的，登记机关在完成变更登记或者注销登记后，通过国家企业信用信息公示系统公告营业执照作废。
