违规扣分一般在发证的第二年当日清零。道路交通安全违法行为累积记分周期为12个月，满分为12分，从机动车驾驶证初次领取之日起计算，如此类推不断地循环。驾驶证的清分时间是驾驶证上的发证日期，每年在发证日期那天系统自动清分。
法律依据：
《机动车驾驶证申领和使用规定》第六十五条
道路交通安全违法行为累积记分周期（即记分周期）为12个月，满分为12分，从机动车驾驶证初次领取之日起计算。
《道路交通安全法实施条例》第二十三条
公安机关交通管理部门对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为除给予行政处罚外，实行道路交通安全违法行为累积记分（以下简称记分）制度，记分周期为12个月。对在一个记分周期内记分达到12分的，由公安机关交通管理部门扣留其机动车驾驶证，该机动车驾驶人应当按照规定参加道路交通安全法律、法规的学习并接受考试。考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。
